Mardin Artuklu Üniversitesi, 28 Mayıs 2007 tarihinde, 5662 Sayılı “Yükseköğretim Kurumları Teşkilatı Kanununda ve Yükseköğretim Kurumları Öğretim Elemanlarının Kadroları Hakkında Kanun Hükmünde Kararname ile Genel Kadro ve Usulü Hakkında Kanun Hükmünde Kararnameye Ekli Cetvellerde Değişiklik Yapılmasına Dair Kanun” ile kurulmuş ve Ahmet Necdet Sezer tarafından onaylanmıştır. Üniversite, 2007–2008 eğitim-öğretim yılında öğrenci alarak 83 öğrenci ile eğitim-öğretime başlamıştır.
Fakülteler
- Edebiyat Fakültesi
- Mühendislik Mimarlık Fakültesi
- İslami İlimler Fakültesi
- Güzel Sanatlar Fakültesi
- İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi
- Fen Fakültesi
- Midyat Sanat ve Tasarım Fakültesi
- Sağlık Bilimleri Fakültesi
- Turizm Fakültesi
- Kızıltepe Tarım Bilimleri ve Teknolojileri Fakültesi
- Tıp Fakültesi
Enstitüler
- Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Yaşayan Diller Enstitüsü
Meslek Yüksekokulları
- Derik Meslek Yüksekokulu
- Mardin Meslek Yüksekokulu
- Midyat Meslek Yüksekokulu
- Kızıltepe Meslek Yüksekokulu
- Nusaybin Meslek Yüksekokulu
- Ömerli Meslek Yüksekokulu
- Savur Meslek Yüksekokulu
- Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu
Yüksekokullar
- Beden Eğitimi ve Spor Yüksekokulu
- Devlet Konservatuvarı
- Yabancı Diller Yüksekokulu
