Harran Üniversitesi, Şanlıurfa ilinde kurulan ve bölgedeki ilk yüksek öğretim birimi olan Şanlıurfa Meslek Yüksekokulu’nun 1976 yılında faaliyete geçmesiyle eğitim-öğretim faaliyetlerine başlamıştır. Ardından, Dicle Üniversitesi’ne bağlı Ziraat Fakültesi (1978), Mühendislik Fakültesi İnşaat Bölümü (1984) ve Gaziantep Üniversitesi’ne bağlı İlahiyat Fakültesi (1988) kurulmuş olup, üniversite daha sonra Harran Üniversitesi adını alarak bağımsız bir kurum haline gelmiştir. Bugün, üniversite 9 fakülte, 3 yüksekokul, 11 meslek yüksekokulu, 3 enstitü ve 9 araştırma ve uygulama merkezi ile faaliyetlerini sürdürmektedir.
Fakülteler
- Diş Hekimliği Fakültesi
- Eczacılık Fakültesi
- Eğitim Fakültesi
- Fen Edebiyat Fakültesi
- Güzel Sanatlar Fakültesi
- İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi
- İlahiyat Fakültesi
- Mühendislik Fakültesi
- Sağlık Bilimleri Fakültesi
- Siverek Uygulamalı Bilimler Fakültesi
- Tıp Fakültesi
- Turizm Fakültesi
- Veteriner Fakültesi
- Ziraat Fakültesi
Yüksekokullar ve Devlet Konservatuvarı
- Mehmet Arabacı Beden Eğitimi ve Spor Yüksekokulu
- Devlet Konservatuvarı
- Viranşehir Sağlık Yüksekokulu
- Yabancı Diller Yüksekokulu
Enstitüler
- Fen Bilimleri Enstitüsü
- Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Sosyal Bilimler Enstitüsü
Meslek Yüksekokulları
- Akçakale Meslek Yüksekokulu
- Birecik Meslek Yüksekokulu
- Bozova Meslek Yüksekokulu
- Ceylanpınar Meslek Yüksekokulu
- Halfeti Meslek Yüksekokulu
- Harran Meslek Yüksekokulu
- Hilvan Meslek Yüksekokulu
- Organize Sanayi Bölgesi Meslek Yüksekokulu
- Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu
- Siverek Meslek Yüksekokulu
- Sosyal Bilimler Meslek Yüksekokulu
- Suruç Meslek Yüksekokulu
- Teknik Bilimler Meslek Yüksekokulu
- Viranşehir Meslek Yüksekokulu